Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD2Q96BF3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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