Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms