Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms