Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TMIEQ8NEW7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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