Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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