Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3V7

SYNPO, Synaptopodin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPOQ8N3V7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNPOQ8N3V7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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