Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC174Q6PII3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms