Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms