Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBAP2Q5T6F2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms