Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms