Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms