Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms