Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms