Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms