Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms