Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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LAMA3Q16787 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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