Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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