Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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