Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms