Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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