Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCF4Q15080 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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