Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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