Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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