Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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