Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPM6BQ13491 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms