Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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