Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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