Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RLFQ13129 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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