Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TRAF1Q13077 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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