Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
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