Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms