Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV1Q03135 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms