Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK17Q00537 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms