Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms