Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGER3P43115 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms