Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms