Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms