Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLD1P28340 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLD1P28340 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms