Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms