Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ITGA3P26006 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ITGA3P26006 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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ITGA3P26006 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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