Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMA1P25391 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms