Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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