Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGAMP11215 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGAMP11215 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms