Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFLP07196 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFLP07196 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFLP07196 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms