Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms