Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLOCKO15516 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLOCKO15516 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms