Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBDO15205 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBDO15205 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms