Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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