Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E9PBE3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms