Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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